海关将空箱业务纳入新舱单系统，进口空箱申报与进口货物申报流程相同，在进口理货申报完成后，企业需要向海关申报进口空箱的快速验放单。出口空箱申报与出口货物申报流程相同，在出口舱单和运抵备案成功后，企业需要向海关传送出口空箱的快速验放单。海关会将该单证与其他单证数据核对，核对成功后，海关自动给出接收成功的回执，同时触发国际中转放行。出口空箱放行后，企业仍然要申报装载舱单，待海关同意装载后，该货物才可以装船。装船后6小时内，海关监管场所经营人或理货公司需要向海关提交出口理货报告。

        深圳电子口岸平台为企业提供XML报文传输及页面录入功能。并将海关的相关回执和指令传达给申报企业或码头。